Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BccipQ9CWI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BccipQ9CWI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms