Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhfpl3Q9CTN8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms