Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhobtb3Q9CTN4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhobtb3Q9CTN4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhobtb3Q9CTN4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhobtb3Q9CTN4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhobtb3Q9CTN4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms