Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR99

4930544G11Rik, RIKEN cDNA 4930544G11, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544G11RikQ9CR99 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544G11RikQ9CR99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544G11RikQ9CR99 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms