Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45gip1Q9CR59 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms