Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc43Q9CR29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc43Q9CR29 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms