Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rwdd1Q9CQK7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rwdd1Q9CQK7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms