Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms