Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CQC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CQC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CQC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9CQC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms