Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap4Q99P47 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cntnap4Q99P47 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap4Q99P47 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap4Q99P47 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntnap4Q99P47 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntnap4Q99P47 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms