Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird2Q99NI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms