Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bco2Q99NF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bco2Q99NF1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bco2Q99NF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bco2Q99NF1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
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