Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Brms1Q99N20 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brms1Q99N20 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms