Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BrapQ99MP8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
BrapQ99MP8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BrapQ99MP8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms