Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clp1Q99LI9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clp1Q99LI9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clp1Q99LI9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms