Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TriobpQ99KW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TriobpQ99KW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TriobpQ99KW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TriobpQ99KW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms