Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip2Q99JG7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip2Q99JG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnip2Q99JG7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip2Q99JG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms