Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msi2Q920Q6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Msi2Q920Q6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms