Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha1Q91Y21 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha1Q91Y21 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha1Q91Y21 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms