Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chrna2Q91X60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chrna2Q91X60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chrna2Q91X60 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chrna2Q91X60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms