Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 366 ms