Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgdsQ8VDR7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgdsQ8VDR7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TgdsQ8VDR7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TgdsQ8VDR7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TgdsQ8VDR7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TgdsQ8VDR7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TgdsQ8VDR7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TgdsQ8VDR7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms