Protein–RNA interactions for Protein: Q8R314

Slc35f5, Solute carrier family 35 member F5, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35f5Q8R314 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc35f5Q8R314 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35f5Q8R314 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35f5Q8R314 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35f5Q8R314 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms