Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Y2

Uncharacterized protein C16orf45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R1Y2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R1Y2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8R1Y2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R1Y2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8R1Y2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8R1Y2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8R1Y2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R1Y2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R1Y2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R1Y2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R1Y2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R1Y2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R1Y2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R1Y2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R1Y2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q8R1Y2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R1Y2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms