Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casc3Q8K3W3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casc3Q8K3W3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casc3Q8K3W3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms