Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shtn1Q8K2Q9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shtn1Q8K2Q9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Shtn1Q8K2Q9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms