Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrrc9Q8CDN9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lrrc9Q8CDN9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lrrc9Q8CDN9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Lrrc9Q8CDN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrrc9Q8CDN9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms