Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc38Q8CDN8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc38Q8CDN8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms