Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin52Q8CD94 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lin52Q8CD94 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin52Q8CD94 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms