Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara3Q8C850 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scara3Q8C850 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scara3Q8C850 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara3Q8C850 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms