Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930504O13RikQ8C5Z9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930504O13RikQ8C5Z9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930504O13RikQ8C5Z9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms