Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms