Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubqln3Q8C5U9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubqln3Q8C5U9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms