Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm4aQ8BW72 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm4aQ8BW72 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm4aQ8BW72 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms