Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc30Q8BVF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc30Q8BVF4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc30Q8BVF4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms