Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp4aQ8BU40 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4aQ8BU40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4aQ8BU40 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms