Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rd3Q8BRE0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rd3Q8BRE0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms