Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc50Q810U5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc50Q810U5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms