Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb2Q80YA8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Crb2Q80YA8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crb2Q80YA8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crb2Q80YA8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crb2Q80YA8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms