Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Clec18aQ7TSQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Clec18aQ7TSQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec18aQ7TSQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Clec18aQ7TSQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Clec18aQ7TSQ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec18aQ7TSQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms