Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc93Q7TQK5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc93Q7TQK5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc93Q7TQK5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms