Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SugctQ7TNE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SugctQ7TNE1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SugctQ7TNE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SugctQ7TNE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms