Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmc8Q7TN58 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmc8Q7TN58 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmc8Q7TN58 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms