Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Syne1Q6ZWR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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