Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf653Q6YND2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf653Q6YND2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf653Q6YND2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms