Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssx9Q6XAS3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssx9Q6XAS3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssx9Q6XAS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms