Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf3Q6QR59 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf3Q6QR59 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms