Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trak2Q6P9N8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak2Q6P9N8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trak2Q6P9N8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms