Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac4Q6NZM9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac4Q6NZM9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac4Q6NZM9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms