Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colgalt2Q6NVG7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt2Q6NVG7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Colgalt2Q6NVG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt2Q6NVG7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms